瘴医使团”，携带大量药材和太医院整理的瘟疫防治典籍，在精锐禁军护送下，日夜兼程，赶赴陈到大营。
与此同时，韩烈也从江南各地，重金征召通晓南方湿热病症的郎中、熟知本地草药的土人药师，甚至悬赏征集民间防治瘴气的土方、验方，汇集于军中。
陈到在大营中，更是将防治瘴疠、控制疫情提升到了与军事防御同等，甚至更为优先的地位。
他亲自牵头，以随军医官为主体，汇聚朝廷派来的医使、本地招募的郎中药师，成立了一个临时的“瘴疫防治所”，由军中一位资深且心思缜密的军医官秦百草和太医院派来的一位姓林的太医共同主事。
第一步，是隔离与救治。
所有从百越墟撤回的病患，包括刘闯本人，被立即单独隔离在一片通风、干燥的营区。
病患按症状轻重分区安置，严禁与健康士卒接触。
所有照料病患的医工、役夫，必须用煮沸的醋浸泡过的粗布蒙住口鼻，处理污物后严格清洗。
死者尸体一律火化深埋，其衣物用具尽数焚毁。
这些措施，有些是太医带来的中原防治瘟疫的经验，有些则是本地郎中根据“瘴气”特性提出的建议。
虽不能完全阻止疫情扩散，但极大地控制了交叉感染，避免了瘟疫在健康士卒中大规模爆发。
第二步，是改善营地卫生，消除“瘴气”滋生环境。
陈到下令，所有营寨必须迁离低洼潮湿、死水聚集之地，择高燥、通风处扎营。
营内挖掘深沟，排放污水，生活垃圾集中处理、深埋或焚烧。
所有饮用水，必须煮沸后方可饮用，陈到派亲兵队每日巡查，发现饮用生水者，严惩不贷。
营帐内定期用石灰、硫磺、艾草等烟熏。
士卒被强制要求保持个人卫生，勤洗
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